Οι λειτουργικές διαταραχές του πεπτικού συστήματος είναι ομάδες συμπτωμάτων που αφορούν το γαστρεντερικό σύστημα χωρίς όμως να συνδέονται με κάποια γνωστή νόσο. Πρόκειται δηλαδή για ιδιοπαθείς διαταραχές και όχι για ασθένειες. Με το παχύ έντερο συνδέονται περισσότερο η δυσκοιλιότητα και το σύνδρομο ευερεθίστου εντέρου ενώ με το ανώτερο πεπτικό η δυσπεψία, η δυσφαγία και το κάψιμο στο στήθος (οπισθοστερνικός καύσος). Υπολογίζεται ότι από κάποια λειτουργική διαταραχή του πεπτικού μεγάλο ποσοστό του πληθυσμού. Στη δύση, τουλάχιστον 1 στους 4 ανθρώπους έχουν περιοδικά συμπτώματα που μπορούν να τους κατατάξουν σε κάποια από τις κατηγορίες των λειτουργικών διαταραχών.
Η μελέτη των λειτουργικών διαταραχών προχώρησε πολύ μέσω του Rome Foundation που κατηγοριοποίησε με επιστημονικό τρόπο διαταραχές που συχνά είναι δύσκολο να διακριθούν μεταξύ τους. Σύμφωνα λοιπόν με τα νεότερα δεδομένα, με το παχύ έντερο και την ορθοπρωκτική μονάδα συνδέονται οι παρακάτω διαταραχές:
| Λειτουργικές Διαταραχές του Εντέρου | Λειτουργικές Διαταραχές του Ορθού και του Πρωκτού |
| Λειτουργική Δυσκοιλιότητα | Λειτουργική Ακράτεια Κοπράνων |
| Λειτουργικός Μετεωρισμός του Εντέρου | Σύνδρομα Πρωκταλγίας |
| Σύνδρομο Ευερέθιστου Εντέρου |
